En el futuro, Blue City es una moderna ciudad del Planeta Zi llena de rascacielos y autopistas. Allí, las batallas de ZOIDS son populares entre la gente. Un día, descubren que pueden hacer ZOIDS más poderosos combinándolos. El protagonista, RD, ha buscado los legendarios ZOIDS luchando ver Zoids: Fuzors 2004-2005 en numerosas batallas.
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